Alvo de críticas de muitos especialistas da área de Educação, o Exame Nacional que mede o Desempenho dos Estudantes, o Enade, também é contestado por duas das maiores universidade do país.

 A USP e a Unicamp não participam da avaliação, mas negociam uma possível integração para o ano que vem.

O pró-reitor substituto da Universidade de São Paulo, Quirino Augusto de Camargo Carmelo, explica que, pela primeira vez, o Ministério da Educação deu sinais de que pode atender a algumas adequações propostas pela USP.

Segundo o pró-reitor da USP, a principal discussão sobre a prova é o fato de ela ser aplicada apenas por amostragem, e não a todos os alunos. Quirino Augusto de Camargo Carmelo acredita que este critério pode gerar
distorções no resultado do Enade. Outro ponto contestado pela USP é a divulgação da colocação dos alunos.

O pró-reitor da USP acredita que o ranking poderia ser utilizado como meio de promoção para algumas universidades: que passariam a treinar os alunos apenas para o exame, deixando de lado a qualidade do ensino.